1. Введите команду:
df -h

2. У меня получилось вот так:
# df -h
Filesystem Size Used Avail Use% Mounted on
/dev/sda2 549G 30G 492G 6% /
tmpfs 16G 0 16G 0% /dev/shm
/dev/sda1 190M 77M 104M 43% /boot

3. Как видим здесь есть каталог /dev/shm, в который будем сохранять временные файлы базы MySQL.

4. Открываем файл my.cnf и добавляем строку:
tmpdir = /dev/shm

5. Перезапускаем MySQL командой:
service mysql restart

6. Готово! Теперь Ваша база станет быстрее работать!